앤트로픽이 클로드가 4주도 안 되는 기간에 30개 이상의 오픈소스 생체분자 모델을 최적화해 평균 약 4배 속도를 높였다고 밝히고 최적화 코드를 오픈소스로 공개했다. 클로드가 개발한 커스텀 GPU 커널 'FlashPairformer v1'은 알파폴드3 등이 쓰는 삼각 어텐션 연산을 기존 표준 커널보다 최대 2.9배 빠르게 처리했으며, 정확도 저하 없이 구조 예측 모델의 순전파 속도를 최대 4.1배 끌어올렸다. 특히 메모리 효율을 높인 'Big 모드'로 미토콘드리아 복합체 I나 박테리아 리보솜 같은 7만 토큰 이상급 거대 생체분자 구조를 단일 GPU 노드에서 정확히 예측하는 데 성공했다. 앤트로픽은 이와 함께 어답티브바이오와 100만달러 규모의 실험 검증 및 100만달러 상당 클로드 크레딧을 지원하는 단백질 설계 경진대회도 공동 개최한다고 발표했다.
- •클로드가 4주 이내 30개 이상 생체분자 모델 최적화, 평균 약 4배 속도 향상
- •FlashPairformer v1 커널, 삼각 어텐션 연산 최대 2.9배 가속
- •'Big 모드'로 7만 토큰 이상 거대 분자 구조를 단일 GPU 노드에서 정확 예측
- •정확도는 기존 대비 사실상 변화 없음(벤치마크 정확도 54~55%대 유지)
- •어답티브바이오와 공동으로 100만달러+클로드 크레딧 100만달러 규모 단백질 설계 대회 공동 개최
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Anthropic Reports Claude Optimized 30+ Open-Source Biomolecular Models

- 1.Anthropic, Claude가 4주 만에 오픈소스 생체분자 모델 30여 개를 최적화해 평균 약 4배 속도 향상 보고
- 2.Fast 모드는 평균 4.1배, Big 모드는 메모리 절감으로 대형 입력 처리 가능, Exact 모드는 원본과 비트 단위로 동일한 출력 목표
- 3.자체 개발 GPU 커널 FlashPairformer v1이 트라이앵글 어텐션을 업계 표준 대비 최대 2.9배 가속
- 4.미토콘드리아 복합체 I·프로테아좀 등 초대형 생체 구조를 단일 GPU 노드에서 TM-score 0.92~0.997로 정확 예측
왜 중요한가?
추론 최적화·커널 엔지니어링 경험이 전혀 없는 생물학 연구자 2명의 지도만으로 이런 성과를 냈다는 점은, AI가 전문 엔지니어링 인력 없이도 과학 소프트웨어의 성능을 크게 끌어올릴 수 있음을 보여주는 구체적 사례다.
본문 미리보기
Anthropic published a research post on September 17, 2026, reporting that Claude optimized more than 30 open-source biomolecular models in just under four weeks, which the company said sped the models up roughly 4x on average. Anthropic open-sourced the optimized code and announced a protein design competition co-sponsored with Adaptyv Bio. 36 Optimized Packages and FlashPairformer Kernels According to the research post and an accompanying technical report, an internal general-purpose research…
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